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臨床生化檢測系統的測量參數分為基本分析參數（或通用參數）和特殊分析參數（也稱質量保證參數），不同種類的分析儀都需要設置基本分析參數，這些參數缺一不可，而特殊分析參數在不同分析儀上差別很大。

一、臨床生化檢測系統的基本分析參數，主要包括：

1．試驗名稱：或通道名稱，目的是與其他通道相區別，常以項目的英文縮寫來表示。

2．方法類型：檢測方法類型或分析類型至少分為終點法和速率法兩種，其它方法都與這兩類方法有關。

3．反應溫度：一般有30℃、37℃可供選擇，通常固定為37℃。

4．測定波長：后分光技術的分析儀可選擇單波長或雙波長，個別儀器只能選擇雙波長。

5．反應方向：有正向反應和負向反應兩種。

6．樣品量(Sv)：第1試劑量(R1)／第2試劑量(R2)。

7．反應時間：在試劑盒說明書中，終點法會給出反應達到終點的時間，二點法會給出第1次測光點（t1）和第2次測光點（t2），連續監測法會給出反應需要的延遲時間和線性反應時間。

8．校準參數：分析儀測定方法基本上都需要校準（calibration），校準類型分為線性校準和非線性校準。

9．線性范圍、可報告范圍和小數點位數：超過方法的線性范圍（linearity range）時應增加樣品量或減少樣品量重測；有些儀器有檢測結果的小數點位數（decimal point digit）設值。小數點位數增加，K值位數也相應增大，在輸入K值時應引起注意。

10．參考區間：若測定結果在參考區間之外儀器會有提示。

二、臨床生化檢測系統的特殊分析參數，主要包括：

試劑空白（吸光度）檢查、校準核查、血清指數校正、線性檢查、反應限核查、底物耗盡參數、前區/帶現象檢查、自動稀釋參數、尿液參數、防交叉污染參數等。配套與非配套檢測系統的差別在于測量程序的好與壞、有與無、算法的強和弱，客戶端的表現就是解決臨床問題的強弱、解決異常標本檢測結果準確性的能力。

三、臨床生化檢測系統的測量程序分析參數的驗證與固化：

配套檢測系統無論是基本分析參數還是特殊分析參數，廠商均經過反復驗證和全性能確認，形成固定組合，固化于分析儀的計算機中。

國內僅生產試劑的醫療器械廠商沒有辦法做到每種試劑在所有機型都有充分驗證的分析參數，同時，實驗室對自建檢測系統測量程序分析參數的設置很難做到反復驗證和全性能確認，因此，自建檢測系統對分析測量范圍以外的檢驗結果或者特殊樣本的檢驗結果很難有質量保證，往往引起臨床后果時才被發現。